Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FDPSP14324 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FDPSP14324 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
FDPSP14324 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FDPSP14324 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FDPSP14324 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FDPSP14324 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FDPSP14324 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FDPSP14324 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FDPSP14324 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FDPSP14324 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FDPSP14324 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FDPSP14324 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FDPSP14324 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FDPSP14324 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FDPSP14324 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FDPSP14324 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FDPSP14324 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FDPSP14324 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FDPSP14324 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FDPSP14324 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
FDPSP14324 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FDPSP14324 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FDPSP14324 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FDPSP14324 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FDPSP14324 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FDPSP14324 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FDPSP14324 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FDPSP14324 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
FDPSP14324 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FDPSP14324 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FDPSP14324 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FDPSP14324 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FDPSP14324 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FDPSP14324 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FDPSP14324 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FDPSP14324 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FDPSP14324 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FDPSP14324 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FDPSP14324 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FDPSP14324 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FDPSP14324 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FDPSP14324 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FDPSP14324 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FDPSP14324 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
FDPSP14324 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FDPSP14324 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FDPSP14324 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FDPSP14324 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FDPSP14324 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FDPSP14324 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FDPSP14324 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FDPSP14324 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FDPSP14324 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FDPSP14324 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FDPSP14324 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FDPSP14324 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FDPSP14324 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FDPSP14324 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FDPSP14324 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FDPSP14324 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FDPSP14324 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FDPSP14324 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FDPSP14324 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FDPSP14324 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FDPSP14324 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FDPSP14324 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FDPSP14324 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FDPSP14324 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FDPSP14324 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FDPSP14324 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FDPSP14324 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FDPSP14324 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FDPSP14324 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FDPSP14324 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FDPSP14324 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FDPSP14324 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FDPSP14324 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FDPSP14324 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FDPSP14324 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FDPSP14324 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FDPSP14324 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FDPSP14324 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FDPSP14324 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FDPSP14324 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FDPSP14324 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FDPSP14324 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FDPSP14324 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FDPSP14324 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FDPSP14324 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FDPSP14324 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FDPSP14324 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FDPSP14324 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FDPSP14324 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FDPSP14324 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FDPSP14324 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FDPSP14324 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FDPSP14324 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FDPSP14324 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FDPSP14324 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8319.4 ms