Protein–RNA interactions for Protein: P13591

NCAM1, Neural cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM1P13591 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCAM1P13591 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCAM1P13591 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NCAM1P13591 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCAM1P13591 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms