Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF888P0CJ79 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF888P0CJ79 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF888P0CJ79 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms