Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP17L7P0C7H9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP17L7P0C7H9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
USP17L7P0C7H9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP17L7P0C7H9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
USP17L7P0C7H9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP17L7P0C7H9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP17L7P0C7H9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP17L7P0C7H9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP17L7P0C7H9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP17L7P0C7H9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L7P0C7H9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L7P0C7H9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L7P0C7H9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L7P0C7H9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L7P0C7H9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP17L7P0C7H9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP17L7P0C7H9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP17L7P0C7H9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L7P0C7H9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP17L7P0C7H9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L7P0C7H9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms