Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
S1PR4O95977 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
S1PR4O95977 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
S1PR4O95977 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
S1PR4O95977 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms