Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF12O95522 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF12O95522 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF12O95522 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF12O95522 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF12O95522 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF12O95522 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms