Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TO15178 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TO15178 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TO15178 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TO15178 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TO15178 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TO15178 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TO15178 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TO15178 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TO15178 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TO15178 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TO15178 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TO15178 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TO15178 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TO15178 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TO15178 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TO15178 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TO15178 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TO15178 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TO15178 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TO15178 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TO15178 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TO15178 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TO15178 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TO15178 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TO15178 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TO15178 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TO15178 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TO15178 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TO15178 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TO15178 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TO15178 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TO15178 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TO15178 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TO15178 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TO15178 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TO15178 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TO15178 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TO15178 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TO15178 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TO15178 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TO15178 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TO15178 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TO15178 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TO15178 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TO15178 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TO15178 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TO15178 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TO15178 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TO15178 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TO15178 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TO15178 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TO15178 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TO15178 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TO15178 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TO15178 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TO15178 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TO15178 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TO15178 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TO15178 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TO15178 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TO15178 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TO15178 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TO15178 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TO15178 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TO15178 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TO15178 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TO15178 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TO15178 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TO15178 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TO15178 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TO15178 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TO15178 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TO15178 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TO15178 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TO15178 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TO15178 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TO15178 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TO15178 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TO15178 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TO15178 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TO15178 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TO15178 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TO15178 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TO15178 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TO15178 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TO15178 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TO15178 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TO15178 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TO15178 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TO15178 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TO15178 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TO15178 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TO15178 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TO15178 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TO15178 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TO15178 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TO15178 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TO15178 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TO15178 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms