Protein–RNA interactions for Protein: H3BV60

TGFBR3L, Transforming growth factor-beta receptor type 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3LH3BV60 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFBR3LH3BV60 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TGFBR3LH3BV60 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGFBR3LH3BV60 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGFBR3LH3BV60 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGFBR3LH3BV60 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGFBR3LH3BV60 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGFBR3LH3BV60 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TGFBR3LH3BV60 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TGFBR3LH3BV60 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TGFBR3LH3BV60 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGFBR3LH3BV60 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFBR3LH3BV60 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 435 ms