Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPC6Q9Y210 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPC6Q9Y210 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRPC6Q9Y210 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRPC6Q9Y210 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms