Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCOLCE2Q9UKZ9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCOLCE2Q9UKZ9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCOLCE2Q9UKZ9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCOLCE2Q9UKZ9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCOLCE2Q9UKZ9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms