Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA2D2Q9NY47 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D2Q9NY47 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D2Q9NY47 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D2Q9NY47 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D2Q9NY47 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D2Q9NY47 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D2Q9NY47 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D2Q9NY47 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D2Q9NY47 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D2Q9NY47 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA2D2Q9NY47 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA2D2Q9NY47 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA2D2Q9NY47 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA2D2Q9NY47 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA2D2Q9NY47 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA2D2Q9NY47 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA2D2Q9NY47 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA2D2Q9NY47 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA2D2Q9NY47 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA2D2Q9NY47 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA2D2Q9NY47 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D2Q9NY47 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D2Q9NY47 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms