Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR4

ZDHHC12, Probable palmitoyltransferase ZDHHC12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC12Q96GR4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC12Q96GR4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC12Q96GR4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC12Q96GR4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC12Q96GR4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC12Q96GR4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC12Q96GR4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC12Q96GR4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC12Q96GR4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC12Q96GR4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC12Q96GR4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZDHHC12Q96GR4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZDHHC12Q96GR4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZDHHC12Q96GR4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZDHHC12Q96GR4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC12Q96GR4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC12Q96GR4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC12Q96GR4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC12Q96GR4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC12Q96GR4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC12Q96GR4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC12Q96GR4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms