Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GPBAR1Q8TDU6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPBAR1Q8TDU6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBAR1Q8TDU6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GPBAR1Q8TDU6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms