Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RTL6Q6ICC9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTL6Q6ICC9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL6Q6ICC9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTL6Q6ICC9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTL6Q6ICC9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms