Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLFN13Q68D06 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLFN13Q68D06 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLFN13Q68D06 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLFN13Q68D06 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SLFN13Q68D06 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLFN13Q68D06 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLFN13Q68D06 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLFN13Q68D06 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLFN13Q68D06 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLFN13Q68D06 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLFN13Q68D06 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLFN13Q68D06 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLFN13Q68D06 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLFN13Q68D06 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLFN13Q68D06 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLFN13Q68D06 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLFN13Q68D06 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLFN13Q68D06 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLFN13Q68D06 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLFN13Q68D06 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLFN13Q68D06 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms