Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCB1Q12824 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCB1Q12824 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCB1Q12824 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCB1Q12824 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCB1Q12824 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCB1Q12824 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCB1Q12824 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCB1Q12824 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCB1Q12824 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCB1Q12824 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCB1Q12824 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCB1Q12824 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCB1Q12824 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCB1Q12824 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCB1Q12824 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCB1Q12824 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMARCB1Q12824 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCB1Q12824 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCB1Q12824 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCB1Q12824 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMARCB1Q12824 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCB1Q12824 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMARCB1Q12824 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCB1Q12824 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCB1Q12824 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCB1Q12824 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCB1Q12824 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCB1Q12824 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCB1Q12824 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMARCB1Q12824 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMARCB1Q12824 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCB1Q12824 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMARCB1Q12824 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SMARCB1Q12824 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCB1Q12824 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
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