Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GABPAQ06546 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GABPAQ06546 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GABPAQ06546 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GABPAQ06546 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GABPAQ06546 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
GABPAQ06546 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
GABPAQ06546 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GABPAQ06546 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GABPAQ06546 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GABPAQ06546 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GABPAQ06546 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GABPAQ06546 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GABPAQ06546 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GABPAQ06546 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GABPAQ06546 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GABPAQ06546 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GABPAQ06546 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GABPAQ06546 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
GABPAQ06546 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GABPAQ06546 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GABPAQ06546 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GABPAQ06546 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GABPAQ06546 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GABPAQ06546 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GABPAQ06546 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GABPAQ06546 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GABPAQ06546 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GABPAQ06546 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GABPAQ06546 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GABPAQ06546 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GABPAQ06546 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
GABPAQ06546 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GABPAQ06546 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GABPAQ06546 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GABPAQ06546 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GABPAQ06546 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GABPAQ06546 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GABPAQ06546 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GABPAQ06546 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GABPAQ06546 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GABPAQ06546 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GABPAQ06546 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
GABPAQ06546 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GABPAQ06546 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GABPAQ06546 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GABPAQ06546 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GABPAQ06546 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GABPAQ06546 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GABPAQ06546 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GABPAQ06546 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms