Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNP2Q05952 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms