Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFHR1Q03591 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFHR1Q03591 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFHR1Q03591 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms