Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC42EP1Q00587 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDC42EP1Q00587 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC42EP1Q00587 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC42EP1Q00587 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC42EP1Q00587 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC42EP1Q00587 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC42EP1Q00587 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC42EP1Q00587 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDC42EP1Q00587 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC42EP1Q00587 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC42EP1Q00587 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC42EP1Q00587 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC42EP1Q00587 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC42EP1Q00587 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC42EP1Q00587 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC42EP1Q00587 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDC42EP1Q00587 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms