Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACTR1BP42025 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTR1BP42025 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTR1BP42025 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTR1BP42025 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms