Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF7P17544 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF7P17544 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF7P17544 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF7P17544 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATF7P17544 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF7P17544 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF7P17544 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF7P17544 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF7P17544 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF7P17544 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF7P17544 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF7P17544 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF7P17544 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF7P17544 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF7P17544 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF7P17544 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF7P17544 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF7P17544 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATF7P17544 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATF7P17544 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF7P17544 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF7P17544 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF7P17544 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF7P17544 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF7P17544 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF7P17544 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF7P17544 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF7P17544 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF7P17544 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF7P17544 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF7P17544 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF7P17544 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF7P17544 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATF7P17544 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATF7P17544 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF7P17544 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATF7P17544 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATF7P17544 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATF7P17544 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATF7P17544 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATF7P17544 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATF7P17544 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7P17544 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7P17544 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7P17544 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7P17544 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF7P17544 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATF7P17544 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATF7P17544 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATF7P17544 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATF7P17544 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATF7P17544 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATF7P17544 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF7P17544 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATF7P17544 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF7P17544 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ATF7P17544 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF7P17544 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF7P17544 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF7P17544 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF7P17544 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF7P17544 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF7P17544 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF7P17544 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF7P17544 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF7P17544 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF7P17544 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF7P17544 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF7P17544 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF7P17544 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF7P17544 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF7P17544 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF7P17544 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF7P17544 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF7P17544 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF7P17544 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF7P17544 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATF7P17544 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF7P17544 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF7P17544 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF7P17544 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF7P17544 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF7P17544 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF7P17544 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF7P17544 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF7P17544 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF7P17544 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF7P17544 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF7P17544 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF7P17544 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF7P17544 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF7P17544 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF7P17544 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF7P17544 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF7P17544 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF7P17544 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF7P17544 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ATF7P17544 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF7P17544 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms