Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYL4P12829 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYL4P12829 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYL4P12829 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYL4P12829 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYL4P12829 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYL4P12829 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYL4P12829 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYL4P12829 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYL4P12829 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYL4P12829 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYL4P12829 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYL4P12829 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYL4P12829 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MYL4P12829 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYL4P12829 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYL4P12829 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYL4P12829 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYL4P12829 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYL4P12829 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYL4P12829 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYL4P12829 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYL4P12829 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYL4P12829 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYL4P12829 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYL4P12829 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYL4P12829 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MYL4P12829 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYL4P12829 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYL4P12829 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYL4P12829 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYL4P12829 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYL4P12829 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYL4P12829 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MYL4P12829 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYL4P12829 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYL4P12829 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYL4P12829 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MYL4P12829 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYL4P12829 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYL4P12829 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYL4P12829 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYL4P12829 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYL4P12829 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYL4P12829 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYL4P12829 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYL4P12829 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYL4P12829 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYL4P12829 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYL4P12829 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MYL4P12829 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MYL4P12829 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MYL4P12829 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYL4P12829 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYL4P12829 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYL4P12829 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYL4P12829 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYL4P12829 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYL4P12829 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYL4P12829 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYL4P12829 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYL4P12829 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYL4P12829 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYL4P12829 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYL4P12829 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYL4P12829 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYL4P12829 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYL4P12829 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MYL4P12829 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYL4P12829 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYL4P12829 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYL4P12829 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYL4P12829 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYL4P12829 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYL4P12829 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYL4P12829 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYL4P12829 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MYL4P12829 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYL4P12829 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYL4P12829 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYL4P12829 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYL4P12829 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYL4P12829 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYL4P12829 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYL4P12829 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYL4P12829 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYL4P12829 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MYL4P12829 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYL4P12829 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYL4P12829 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYL4P12829 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYL4P12829 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYL4P12829 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MYL4P12829 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYL4P12829 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYL4P12829 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYL4P12829 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYL4P12829 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYL4P12829 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYL4P12829 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms