Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI4P10075 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI4P10075 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI4P10075 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI4P10075 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI4P10075 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI4P10075 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI4P10075 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI4P10075 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI4P10075 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI4P10075 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI4P10075 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI4P10075 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI4P10075 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI4P10075 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI4P10075 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI4P10075 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI4P10075 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI4P10075 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI4P10075 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI4P10075 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI4P10075 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI4P10075 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI4P10075 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI4P10075 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI4P10075 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI4P10075 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI4P10075 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI4P10075 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI4P10075 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI4P10075 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI4P10075 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI4P10075 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI4P10075 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI4P10075 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI4P10075 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI4P10075 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI4P10075 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI4P10075 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI4P10075 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI4P10075 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLI4P10075 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI4P10075 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI4P10075 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI4P10075 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI4P10075 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI4P10075 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI4P10075 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI4P10075 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI4P10075 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI4P10075 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI4P10075 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI4P10075 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI4P10075 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI4P10075 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI4P10075 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI4P10075 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI4P10075 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI4P10075 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI4P10075 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI4P10075 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI4P10075 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI4P10075 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI4P10075 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI4P10075 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI4P10075 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GLI4P10075 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI4P10075 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI4P10075 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI4P10075 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI4P10075 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI4P10075 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI4P10075 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI4P10075 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI4P10075 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI4P10075 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI4P10075 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI4P10075 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI4P10075 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI4P10075 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI4P10075 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI4P10075 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI4P10075 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI4P10075 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI4P10075 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI4P10075 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI4P10075 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI4P10075 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI4P10075 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI4P10075 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI4P10075 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI4P10075 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI4P10075 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI4P10075 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI4P10075 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI4P10075 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI4P10075 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI4P10075 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI4P10075 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI4P10075 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms