Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HOXB7P09629 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HOXB7P09629 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HOXB7P09629 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HOXB7P09629 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
HOXB7P09629 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HOXB7P09629 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HOXB7P09629 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
HOXB7P09629 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
HOXB7P09629 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HOXB7P09629 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.77
HOXB7P09629 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HOXB7P09629 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HOXB7P09629 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HOXB7P09629 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
HOXB7P09629 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HOXB7P09629 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HOXB7P09629 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HOXB7P09629 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HOXB7P09629 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HOXB7P09629 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HOXB7P09629 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HOXB7P09629 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
HOXB7P09629 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HOXB7P09629 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HOXB7P09629 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HOXB7P09629 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HOXB7P09629 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
HOXB7P09629 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HOXB7P09629 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HOXB7P09629 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HOXB7P09629 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
HOXB7P09629 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms