Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRNPP04156 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRNPP04156 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRNPP04156 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRNPP04156 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRNPP04156 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRNPP04156 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRNPP04156 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRNPP04156 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRNPP04156 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRNPP04156 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRNPP04156 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRNPP04156 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRNPP04156 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRNPP04156 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRNPP04156 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRNPP04156 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRNPP04156 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRNPP04156 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRNPP04156 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRNPP04156 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRNPP04156 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRNPP04156 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRNPP04156 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRNPP04156 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRNPP04156 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRNPP04156 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRNPP04156 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRNPP04156 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRNPP04156 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRNPP04156 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRNPP04156 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRNPP04156 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRNPP04156 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRNPP04156 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRNPP04156 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRNPP04156 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRNPP04156 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRNPP04156 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRNPP04156 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRNPP04156 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRNPP04156 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRNPP04156 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRNPP04156 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRNPP04156 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRNPP04156 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRNPP04156 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRNPP04156 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRNPP04156 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRNPP04156 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRNPP04156 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRNPP04156 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRNPP04156 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRNPP04156 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRNPP04156 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRNPP04156 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRNPP04156 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRNPP04156 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRNPP04156 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRNPP04156 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRNPP04156 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRNPP04156 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRNPP04156 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRNPP04156 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRNPP04156 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRNPP04156 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRNPP04156 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRNPP04156 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRNPP04156 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRNPP04156 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRNPP04156 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRNPP04156 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRNPP04156 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRNPP04156 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRNPP04156 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRNPP04156 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRNPP04156 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRNPP04156 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRNPP04156 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRNPP04156 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRNPP04156 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRNPP04156 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRNPP04156 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRNPP04156 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRNPP04156 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRNPP04156 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRNPP04156 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRNPP04156 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRNPP04156 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRNPP04156 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRNPP04156 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRNPP04156 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRNPP04156 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRNPP04156 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRNPP04156 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRNPP04156 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRNPP04156 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRNPP04156 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRNPP04156 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRNPP04156 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms