Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIN2DO15399 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2DO15399 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN2DO15399 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GRIN2DO15399 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN2DO15399 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN2DO15399 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN2DO15399 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN2DO15399 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN2DO15399 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2DO15399 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2DO15399 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2DO15399 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2DO15399 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2DO15399 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2DO15399 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2DO15399 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIN2DO15399 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIN2DO15399 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN2DO15399 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN2DO15399 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms