Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GFRA2O00451 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GFRA2O00451 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GFRA2O00451 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GFRA2O00451 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms