Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SRRM5B3KS81 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRRM5B3KS81 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRRM5B3KS81 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRRM5B3KS81 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRRM5B3KS81 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms