Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PCDHB4Q9Y5E5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PCDHB4Q9Y5E5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
PCDHB4Q9Y5E5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PCDHB4Q9Y5E5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PCDHB4Q9Y5E5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PCDHB4Q9Y5E5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PCDHB4Q9Y5E5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PCDHB4Q9Y5E5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PCDHB4Q9Y5E5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PCDHB4Q9Y5E5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PCDHB4Q9Y5E5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PCDHB4Q9Y5E5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PCDHB4Q9Y5E5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PCDHB4Q9Y5E5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PCDHB4Q9Y5E5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PCDHB4Q9Y5E5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PCDHB4Q9Y5E5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PCDHB4Q9Y5E5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PCDHB4Q9Y5E5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PCDHB4Q9Y5E5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PCDHB4Q9Y5E5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PCDHB4Q9Y5E5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PCDHB4Q9Y5E5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PCDHB4Q9Y5E5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PCDHB4Q9Y5E5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PCDHB4Q9Y5E5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PCDHB4Q9Y5E5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PCDHB4Q9Y5E5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PCDHB4Q9Y5E5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PCDHB4Q9Y5E5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PCDHB4Q9Y5E5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PCDHB4Q9Y5E5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PCDHB4Q9Y5E5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PCDHB4Q9Y5E5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PCDHB4Q9Y5E5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PCDHB4Q9Y5E5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PCDHB4Q9Y5E5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PCDHB4Q9Y5E5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PCDHB4Q9Y5E5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCDHB4Q9Y5E5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCDHB4Q9Y5E5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PCDHB4Q9Y5E5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PCDHB4Q9Y5E5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PCDHB4Q9Y5E5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PCDHB4Q9Y5E5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PCDHB4Q9Y5E5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PCDHB4Q9Y5E5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PCDHB4Q9Y5E5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PCDHB4Q9Y5E5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PCDHB4Q9Y5E5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PCDHB4Q9Y5E5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PCDHB4Q9Y5E5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PCDHB4Q9Y5E5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PCDHB4Q9Y5E5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PCDHB4Q9Y5E5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PCDHB4Q9Y5E5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PCDHB4Q9Y5E5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PCDHB4Q9Y5E5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PCDHB4Q9Y5E5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PCDHB4Q9Y5E5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PCDHB4Q9Y5E5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PCDHB4Q9Y5E5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PCDHB4Q9Y5E5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PCDHB4Q9Y5E5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PCDHB4Q9Y5E5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PCDHB4Q9Y5E5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PCDHB4Q9Y5E5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PCDHB4Q9Y5E5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCDHB4Q9Y5E5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCDHB4Q9Y5E5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PCDHB4Q9Y5E5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PCDHB4Q9Y5E5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PCDHB4Q9Y5E5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PCDHB4Q9Y5E5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PCDHB4Q9Y5E5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PCDHB4Q9Y5E5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PCDHB4Q9Y5E5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PCDHB4Q9Y5E5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PCDHB4Q9Y5E5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PCDHB4Q9Y5E5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PCDHB4Q9Y5E5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PCDHB4Q9Y5E5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PCDHB4Q9Y5E5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PCDHB4Q9Y5E5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PCDHB4Q9Y5E5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
PCDHB4Q9Y5E5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PCDHB4Q9Y5E5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PCDHB4Q9Y5E5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PCDHB4Q9Y5E5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PCDHB4Q9Y5E5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PCDHB4Q9Y5E5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PCDHB4Q9Y5E5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PCDHB4Q9Y5E5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PCDHB4Q9Y5E5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PCDHB4Q9Y5E5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PCDHB4Q9Y5E5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PCDHB4Q9Y5E5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PCDHB4Q9Y5E5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms