Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R5

DOPEY2, Protein dopey-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DOPEY2Q9Y3R5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
DOPEY2Q9Y3R5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DOPEY2Q9Y3R5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DOPEY2Q9Y3R5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DOPEY2Q9Y3R5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DOPEY2Q9Y3R5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DOPEY2Q9Y3R5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DOPEY2Q9Y3R5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DOPEY2Q9Y3R5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DOPEY2Q9Y3R5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DOPEY2Q9Y3R5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DOPEY2Q9Y3R5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DOPEY2Q9Y3R5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DOPEY2Q9Y3R5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DOPEY2Q9Y3R5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DOPEY2Q9Y3R5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DOPEY2Q9Y3R5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DOPEY2Q9Y3R5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DOPEY2Q9Y3R5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DOPEY2Q9Y3R5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DOPEY2Q9Y3R5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DOPEY2Q9Y3R5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DOPEY2Q9Y3R5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
DOPEY2Q9Y3R5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
DOPEY2Q9Y3R5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DOPEY2Q9Y3R5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DOPEY2Q9Y3R5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DOPEY2Q9Y3R5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DOPEY2Q9Y3R5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DOPEY2Q9Y3R5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DOPEY2Q9Y3R5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DOPEY2Q9Y3R5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DOPEY2Q9Y3R5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DOPEY2Q9Y3R5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DOPEY2Q9Y3R5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DOPEY2Q9Y3R5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DOPEY2Q9Y3R5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DOPEY2Q9Y3R5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DOPEY2Q9Y3R5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DOPEY2Q9Y3R5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DOPEY2Q9Y3R5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DOPEY2Q9Y3R5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DOPEY2Q9Y3R5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DOPEY2Q9Y3R5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DOPEY2Q9Y3R5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DOPEY2Q9Y3R5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DOPEY2Q9Y3R5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
DOPEY2Q9Y3R5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DOPEY2Q9Y3R5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DOPEY2Q9Y3R5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DOPEY2Q9Y3R5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DOPEY2Q9Y3R5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DOPEY2Q9Y3R5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DOPEY2Q9Y3R5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DOPEY2Q9Y3R5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DOPEY2Q9Y3R5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DOPEY2Q9Y3R5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DOPEY2Q9Y3R5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DOPEY2Q9Y3R5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DOPEY2Q9Y3R5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DOPEY2Q9Y3R5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DOPEY2Q9Y3R5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DOPEY2Q9Y3R5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DOPEY2Q9Y3R5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DOPEY2Q9Y3R5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DOPEY2Q9Y3R5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DOPEY2Q9Y3R5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DOPEY2Q9Y3R5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DOPEY2Q9Y3R5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DOPEY2Q9Y3R5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DOPEY2Q9Y3R5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DOPEY2Q9Y3R5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DOPEY2Q9Y3R5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DOPEY2Q9Y3R5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DOPEY2Q9Y3R5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DOPEY2Q9Y3R5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DOPEY2Q9Y3R5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DOPEY2Q9Y3R5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DOPEY2Q9Y3R5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DOPEY2Q9Y3R5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DOPEY2Q9Y3R5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DOPEY2Q9Y3R5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DOPEY2Q9Y3R5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DOPEY2Q9Y3R5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DOPEY2Q9Y3R5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DOPEY2Q9Y3R5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DOPEY2Q9Y3R5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DOPEY2Q9Y3R5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DOPEY2Q9Y3R5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DOPEY2Q9Y3R5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DOPEY2Q9Y3R5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DOPEY2Q9Y3R5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DOPEY2Q9Y3R5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DOPEY2Q9Y3R5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DOPEY2Q9Y3R5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DOPEY2Q9Y3R5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DOPEY2Q9Y3R5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DOPEY2Q9Y3R5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DOPEY2Q9Y3R5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DOPEY2Q9Y3R5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms