Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CDH7Q9ULB5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CDH7Q9ULB5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CDH7Q9ULB5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CDH7Q9ULB5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CDH7Q9ULB5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CDH7Q9ULB5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CDH7Q9ULB5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CDH7Q9ULB5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDH7Q9ULB5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CDH7Q9ULB5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDH7Q9ULB5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDH7Q9ULB5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDH7Q9ULB5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CDH7Q9ULB5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDH7Q9ULB5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CDH7Q9ULB5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CDH7Q9ULB5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CDH7Q9ULB5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CDH7Q9ULB5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDH7Q9ULB5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDH7Q9ULB5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDH7Q9ULB5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CDH7Q9ULB5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CDH7Q9ULB5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDH7Q9ULB5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CDH7Q9ULB5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CDH7Q9ULB5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CDH7Q9ULB5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CDH7Q9ULB5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CDH7Q9ULB5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDH7Q9ULB5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDH7Q9ULB5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CDH7Q9ULB5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CDH7Q9ULB5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDH7Q9ULB5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDH7Q9ULB5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CDH7Q9ULB5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CDH7Q9ULB5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDH7Q9ULB5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDH7Q9ULB5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDH7Q9ULB5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDH7Q9ULB5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CDH7Q9ULB5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDH7Q9ULB5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CDH7Q9ULB5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CDH7Q9ULB5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CDH7Q9ULB5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CDH7Q9ULB5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CDH7Q9ULB5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CDH7Q9ULB5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CDH7Q9ULB5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CDH7Q9ULB5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDH7Q9ULB5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDH7Q9ULB5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CDH7Q9ULB5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CDH7Q9ULB5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDH7Q9ULB5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDH7Q9ULB5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDH7Q9ULB5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDH7Q9ULB5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDH7Q9ULB5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CDH7Q9ULB5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDH7Q9ULB5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDH7Q9ULB5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDH7Q9ULB5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDH7Q9ULB5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CDH7Q9ULB5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDH7Q9ULB5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDH7Q9ULB5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDH7Q9ULB5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDH7Q9ULB5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDH7Q9ULB5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CDH7Q9ULB5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CDH7Q9ULB5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.57
CDH7Q9ULB5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CDH7Q9ULB5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CDH7Q9ULB5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CDH7Q9ULB5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CDH7Q9ULB5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CDH7Q9ULB5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CDH7Q9ULB5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CDH7Q9ULB5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CDH7Q9ULB5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CDH7Q9ULB5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CDH7Q9ULB5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CDH7Q9ULB5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CDH7Q9ULB5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
CDH7Q9ULB5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDH7Q9ULB5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDH7Q9ULB5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDH7Q9ULB5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDH7Q9ULB5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDH7Q9ULB5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDH7Q9ULB5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
CDH7Q9ULB5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDH7Q9ULB5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDH7Q9ULB5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDH7Q9ULB5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDH7Q9ULB5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms