Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CASP8AP2Q9UKL3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CASP8AP2Q9UKL3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CASP8AP2Q9UKL3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CASP8AP2Q9UKL3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CASP8AP2Q9UKL3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CASP8AP2Q9UKL3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CASP8AP2Q9UKL3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CASP8AP2Q9UKL3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CASP8AP2Q9UKL3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CASP8AP2Q9UKL3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CASP8AP2Q9UKL3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CASP8AP2Q9UKL3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CASP8AP2Q9UKL3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CASP8AP2Q9UKL3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CASP8AP2Q9UKL3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CASP8AP2Q9UKL3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
CASP8AP2Q9UKL3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CASP8AP2Q9UKL3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CASP8AP2Q9UKL3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CASP8AP2Q9UKL3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CASP8AP2Q9UKL3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CASP8AP2Q9UKL3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
CASP8AP2Q9UKL3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CASP8AP2Q9UKL3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CASP8AP2Q9UKL3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CASP8AP2Q9UKL3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CASP8AP2Q9UKL3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CASP8AP2Q9UKL3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CASP8AP2Q9UKL3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CASP8AP2Q9UKL3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CASP8AP2Q9UKL3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CASP8AP2Q9UKL3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
CASP8AP2Q9UKL3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CASP8AP2Q9UKL3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
CASP8AP2Q9UKL3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CASP8AP2Q9UKL3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CASP8AP2Q9UKL3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CASP8AP2Q9UKL3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CASP8AP2Q9UKL3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CASP8AP2Q9UKL3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CASP8AP2Q9UKL3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CASP8AP2Q9UKL3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CASP8AP2Q9UKL3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CASP8AP2Q9UKL3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CASP8AP2Q9UKL3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CASP8AP2Q9UKL3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
CASP8AP2Q9UKL3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CASP8AP2Q9UKL3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CASP8AP2Q9UKL3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CASP8AP2Q9UKL3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CASP8AP2Q9UKL3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CASP8AP2Q9UKL3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CASP8AP2Q9UKL3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CASP8AP2Q9UKL3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CASP8AP2Q9UKL3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CASP8AP2Q9UKL3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CASP8AP2Q9UKL3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CASP8AP2Q9UKL3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CASP8AP2Q9UKL3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CASP8AP2Q9UKL3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CASP8AP2Q9UKL3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CASP8AP2Q9UKL3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CASP8AP2Q9UKL3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CASP8AP2Q9UKL3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CASP8AP2Q9UKL3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CASP8AP2Q9UKL3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CASP8AP2Q9UKL3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CASP8AP2Q9UKL3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CASP8AP2Q9UKL3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CASP8AP2Q9UKL3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CASP8AP2Q9UKL3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CASP8AP2Q9UKL3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CASP8AP2Q9UKL3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CASP8AP2Q9UKL3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CASP8AP2Q9UKL3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CASP8AP2Q9UKL3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CASP8AP2Q9UKL3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CASP8AP2Q9UKL3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CASP8AP2Q9UKL3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CASP8AP2Q9UKL3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CASP8AP2Q9UKL3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CASP8AP2Q9UKL3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CASP8AP2Q9UKL3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
CASP8AP2Q9UKL3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CASP8AP2Q9UKL3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CASP8AP2Q9UKL3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CASP8AP2Q9UKL3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CASP8AP2Q9UKL3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CASP8AP2Q9UKL3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CASP8AP2Q9UKL3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CASP8AP2Q9UKL3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms