Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGT4

SUSD2, Sushi domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD2Q9UGT4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SUSD2Q9UGT4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SUSD2Q9UGT4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SUSD2Q9UGT4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SUSD2Q9UGT4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SUSD2Q9UGT4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SUSD2Q9UGT4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SUSD2Q9UGT4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SUSD2Q9UGT4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SUSD2Q9UGT4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SUSD2Q9UGT4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SUSD2Q9UGT4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SUSD2Q9UGT4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SUSD2Q9UGT4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SUSD2Q9UGT4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SUSD2Q9UGT4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SUSD2Q9UGT4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SUSD2Q9UGT4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SUSD2Q9UGT4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SUSD2Q9UGT4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SUSD2Q9UGT4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SUSD2Q9UGT4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SUSD2Q9UGT4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SUSD2Q9UGT4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SUSD2Q9UGT4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SUSD2Q9UGT4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SUSD2Q9UGT4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SUSD2Q9UGT4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SUSD2Q9UGT4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SUSD2Q9UGT4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SUSD2Q9UGT4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SUSD2Q9UGT4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SUSD2Q9UGT4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SUSD2Q9UGT4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
SUSD2Q9UGT4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SUSD2Q9UGT4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SUSD2Q9UGT4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
SUSD2Q9UGT4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SUSD2Q9UGT4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SUSD2Q9UGT4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SUSD2Q9UGT4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SUSD2Q9UGT4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SUSD2Q9UGT4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SUSD2Q9UGT4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SUSD2Q9UGT4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SUSD2Q9UGT4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SUSD2Q9UGT4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SUSD2Q9UGT4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SUSD2Q9UGT4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SUSD2Q9UGT4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SUSD2Q9UGT4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SUSD2Q9UGT4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SUSD2Q9UGT4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SUSD2Q9UGT4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SUSD2Q9UGT4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SUSD2Q9UGT4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SUSD2Q9UGT4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SUSD2Q9UGT4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SUSD2Q9UGT4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SUSD2Q9UGT4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SUSD2Q9UGT4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SUSD2Q9UGT4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SUSD2Q9UGT4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SUSD2Q9UGT4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SUSD2Q9UGT4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SUSD2Q9UGT4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SUSD2Q9UGT4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SUSD2Q9UGT4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SUSD2Q9UGT4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SUSD2Q9UGT4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SUSD2Q9UGT4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SUSD2Q9UGT4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SUSD2Q9UGT4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SUSD2Q9UGT4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SUSD2Q9UGT4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SUSD2Q9UGT4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SUSD2Q9UGT4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SUSD2Q9UGT4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SUSD2Q9UGT4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SUSD2Q9UGT4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SUSD2Q9UGT4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUSD2Q9UGT4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SUSD2Q9UGT4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUSD2Q9UGT4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUSD2Q9UGT4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SUSD2Q9UGT4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SUSD2Q9UGT4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SUSD2Q9UGT4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUSD2Q9UGT4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUSD2Q9UGT4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SUSD2Q9UGT4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SUSD2Q9UGT4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SUSD2Q9UGT4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SUSD2Q9UGT4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SUSD2Q9UGT4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SUSD2Q9UGT4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SUSD2Q9UGT4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SUSD2Q9UGT4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SUSD2Q9UGT4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SUSD2Q9UGT4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms