Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
MYOFQ9NZM1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
MYOFQ9NZM1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MYOFQ9NZM1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
MYOFQ9NZM1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MYOFQ9NZM1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MYOFQ9NZM1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
MYOFQ9NZM1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MYOFQ9NZM1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
MYOFQ9NZM1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
MYOFQ9NZM1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
MYOFQ9NZM1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
MYOFQ9NZM1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
MYOFQ9NZM1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
MYOFQ9NZM1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MYOFQ9NZM1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MYOFQ9NZM1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
MYOFQ9NZM1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
MYOFQ9NZM1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
MYOFQ9NZM1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
MYOFQ9NZM1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MYOFQ9NZM1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MYOFQ9NZM1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MYOFQ9NZM1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MYOFQ9NZM1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MYOFQ9NZM1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MYOFQ9NZM1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
MYOFQ9NZM1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MYOFQ9NZM1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
MYOFQ9NZM1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
MYOFQ9NZM1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MYOFQ9NZM1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
MYOFQ9NZM1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
MYOFQ9NZM1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MYOFQ9NZM1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MYOFQ9NZM1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MYOFQ9NZM1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
MYOFQ9NZM1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
MYOFQ9NZM1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MYOFQ9NZM1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
MYOFQ9NZM1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
MYOFQ9NZM1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
MYOFQ9NZM1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MYOFQ9NZM1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
MYOFQ9NZM1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
MYOFQ9NZM1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MYOFQ9NZM1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MYOFQ9NZM1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MYOFQ9NZM1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
MYOFQ9NZM1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
MYOFQ9NZM1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MYOFQ9NZM1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
MYOFQ9NZM1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MYOFQ9NZM1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MYOFQ9NZM1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MYOFQ9NZM1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MYOFQ9NZM1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MYOFQ9NZM1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MYOFQ9NZM1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
MYOFQ9NZM1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MYOFQ9NZM1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
MYOFQ9NZM1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
MYOFQ9NZM1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
MYOFQ9NZM1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
MYOFQ9NZM1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MYOFQ9NZM1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MYOFQ9NZM1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MYOFQ9NZM1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MYOFQ9NZM1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MYOFQ9NZM1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MYOFQ9NZM1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
MYOFQ9NZM1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MYOFQ9NZM1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
MYOFQ9NZM1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
MYOFQ9NZM1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MYOFQ9NZM1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MYOFQ9NZM1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MYOFQ9NZM1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MYOFQ9NZM1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MYOFQ9NZM1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MYOFQ9NZM1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MYOFQ9NZM1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MYOFQ9NZM1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MYOFQ9NZM1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MYOFQ9NZM1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MYOFQ9NZM1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MYOFQ9NZM1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MYOFQ9NZM1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MYOFQ9NZM1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MYOFQ9NZM1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
MYOFQ9NZM1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYOFQ9NZM1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYOFQ9NZM1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYOFQ9NZM1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYOFQ9NZM1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MYOFQ9NZM1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MYOFQ9NZM1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MYOFQ9NZM1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MYOFQ9NZM1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MYOFQ9NZM1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms