Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC52.12■■■■■ 5.93
RRP7BPQ9NSQ0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC51.07■■■■■ 5.77
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.67■■■■■ 5.7
RRP7BPQ9NSQ0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.44■■■■■ 5.67
RRP7BPQ9NSQ0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
RRP7BPQ9NSQ0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.3■■■■■ 5.64
RRP7BPQ9NSQ0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.26■■■■■ 5.64
RRP7BPQ9NSQ0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC50.07■■■■■ 5.61
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.01■■■■■ 5.44
RRP7BPQ9NSQ0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC48.81■■■■■ 5.4
RRP7BPQ9NSQ0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
RRP7BPQ9NSQ0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC48.69■■■■■ 5.38
RRP7BPQ9NSQ0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC48.69■■■■■ 5.38
RRP7BPQ9NSQ0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC48.68■■■■■ 5.38
RRP7BPQ9NSQ0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.56■■■■■ 5.36
RRP7BPQ9NSQ0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC48.41■■■■■ 5.34
RRP7BPQ9NSQ0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
RRP7BPQ9NSQ0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
RRP7BPQ9NSQ0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
RRP7BPQ9NSQ0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC48.02■■■■■ 5.28
RRP7BPQ9NSQ0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
RRP7BPQ9NSQ0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
RRP7BPQ9NSQ0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.77■■■■■ 5.24
RRP7BPQ9NSQ0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
RRP7BPQ9NSQ0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
RRP7BPQ9NSQ0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
RRP7BPQ9NSQ0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC47.3■■■■■ 5.16
RRP7BPQ9NSQ0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC47.29■■■■■ 5.16
RRP7BPQ9NSQ0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
RRP7BPQ9NSQ0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC47.19■■■■■ 5.14
RRP7BPQ9NSQ0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.05■■■■■ 5.12
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.09
RRP7BPQ9NSQ0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
RRP7BPQ9NSQ0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
RRP7BPQ9NSQ0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
RRP7BPQ9NSQ0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
RRP7BPQ9NSQ0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC46.46■■■■■ 5.03
RRP7BPQ9NSQ0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC46.46■■■■■ 5.03
RRP7BPQ9NSQ0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC46.4■■■■■ 5.02
RRP7BPQ9NSQ0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC46.33■■■■■ 5.01
RRP7BPQ9NSQ0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC46.28■■■■■ 5
RRP7BPQ9NSQ0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC46.2■■■■■ 4.99
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
RRP7BPQ9NSQ0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
RRP7BPQ9NSQ0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
RRP7BPQ9NSQ0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
RRP7BPQ9NSQ0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
RRP7BPQ9NSQ0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
RRP7BPQ9NSQ0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
RRP7BPQ9NSQ0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC45.66■■■■■ 4.9
RRP7BPQ9NSQ0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
RRP7BPQ9NSQ0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.9
RRP7BPQ9NSQ0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
RRP7BPQ9NSQ0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
RRP7BPQ9NSQ0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC45.26■■■■■ 4.84
RRP7BPQ9NSQ0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
RRP7BPQ9NSQ0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.83
RRP7BPQ9NSQ0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
RRP7BPQ9NSQ0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC45.11■■■■■ 4.81
RRP7BPQ9NSQ0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
RRP7BPQ9NSQ0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
RRP7BPQ9NSQ0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC45.03■■■■■ 4.8
RRP7BPQ9NSQ0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
RRP7BPQ9NSQ0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.99■■■■■ 4.79
RRP7BPQ9NSQ0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
RRP7BPQ9NSQ0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
RRP7BPQ9NSQ0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
RRP7BPQ9NSQ0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC44.9■■■■■ 4.78
RRP7BPQ9NSQ0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
RRP7BPQ9NSQ0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
RRP7BPQ9NSQ0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
RRP7BPQ9NSQ0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC44.82■■■■■ 4.77
RRP7BPQ9NSQ0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
RRP7BPQ9NSQ0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
RRP7BPQ9NSQ0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
RRP7BPQ9NSQ0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
RRP7BPQ9NSQ0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC44.76■■■■■ 4.76
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
RRP7BPQ9NSQ0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
RRP7BPQ9NSQ0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
RRP7BPQ9NSQ0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
RRP7BPQ9NSQ0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.72
RRP7BPQ9NSQ0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC44.56■■■■■ 4.72
RRP7BPQ9NSQ0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
RRP7BPQ9NSQ0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
RRP7BPQ9NSQ0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
RRP7BPQ9NSQ0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC44.47■■■■■ 4.71
RRP7BPQ9NSQ0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
RRP7BPQ9NSQ0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
RRP7BPQ9NSQ0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
RRP7BPQ9NSQ0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
RRP7BPQ9NSQ0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
RRP7BPQ9NSQ0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.27■■■■■ 4.68
RRP7BPQ9NSQ0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
RRP7BPQ9NSQ0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
RRP7BPQ9NSQ0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
RRP7BPQ9NSQ0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms