Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCB9Q9NP78 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCB9Q9NP78 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCB9Q9NP78 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCB9Q9NP78 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCB9Q9NP78 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCB9Q9NP78 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCB9Q9NP78 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCB9Q9NP78 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCB9Q9NP78 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCB9Q9NP78 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCB9Q9NP78 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCB9Q9NP78 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCB9Q9NP78 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB9Q9NP78 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCB9Q9NP78 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCB9Q9NP78 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCB9Q9NP78 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB9Q9NP78 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCB9Q9NP78 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCB9Q9NP78 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCB9Q9NP78 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCB9Q9NP78 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCB9Q9NP78 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCB9Q9NP78 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCB9Q9NP78 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCB9Q9NP78 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCB9Q9NP78 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCB9Q9NP78 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCB9Q9NP78 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCB9Q9NP78 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCB9Q9NP78 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCB9Q9NP78 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCB9Q9NP78 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB9Q9NP78 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB9Q9NP78 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCB9Q9NP78 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCB9Q9NP78 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCB9Q9NP78 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCB9Q9NP78 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCB9Q9NP78 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCB9Q9NP78 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ABCB9Q9NP78 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB9Q9NP78 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCB9Q9NP78 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCB9Q9NP78 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCB9Q9NP78 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCB9Q9NP78 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCB9Q9NP78 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCB9Q9NP78 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCB9Q9NP78 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCB9Q9NP78 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCB9Q9NP78 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCB9Q9NP78 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCB9Q9NP78 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCB9Q9NP78 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCB9Q9NP78 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCB9Q9NP78 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCB9Q9NP78 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCB9Q9NP78 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCB9Q9NP78 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCB9Q9NP78 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCB9Q9NP78 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCB9Q9NP78 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCB9Q9NP78 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCB9Q9NP78 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCB9Q9NP78 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCB9Q9NP78 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCB9Q9NP78 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB9Q9NP78 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCB9Q9NP78 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCB9Q9NP78 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB9Q9NP78 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB9Q9NP78 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB9Q9NP78 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB9Q9NP78 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB9Q9NP78 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB9Q9NP78 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCB9Q9NP78 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCB9Q9NP78 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCB9Q9NP78 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCB9Q9NP78 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCB9Q9NP78 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCB9Q9NP78 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCB9Q9NP78 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCB9Q9NP78 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCB9Q9NP78 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCB9Q9NP78 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCB9Q9NP78 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCB9Q9NP78 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCB9Q9NP78 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCB9Q9NP78 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCB9Q9NP78 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCB9Q9NP78 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB9Q9NP78 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB9Q9NP78 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABCB9Q9NP78 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABCB9Q9NP78 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCB9Q9NP78 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCB9Q9NP78 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms