Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PARVBQ9HBI1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PARVBQ9HBI1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
PARVBQ9HBI1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PARVBQ9HBI1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PARVBQ9HBI1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PARVBQ9HBI1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PARVBQ9HBI1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PARVBQ9HBI1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PARVBQ9HBI1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PARVBQ9HBI1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PARVBQ9HBI1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PARVBQ9HBI1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PARVBQ9HBI1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PARVBQ9HBI1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PARVBQ9HBI1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PARVBQ9HBI1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PARVBQ9HBI1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PARVBQ9HBI1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PARVBQ9HBI1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PARVBQ9HBI1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PARVBQ9HBI1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PARVBQ9HBI1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PARVBQ9HBI1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PARVBQ9HBI1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PARVBQ9HBI1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PARVBQ9HBI1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PARVBQ9HBI1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PARVBQ9HBI1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PARVBQ9HBI1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PARVBQ9HBI1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PARVBQ9HBI1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PARVBQ9HBI1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARVBQ9HBI1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PARVBQ9HBI1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PARVBQ9HBI1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PARVBQ9HBI1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PARVBQ9HBI1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PARVBQ9HBI1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARVBQ9HBI1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PARVBQ9HBI1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PARVBQ9HBI1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PARVBQ9HBI1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PARVBQ9HBI1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PARVBQ9HBI1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PARVBQ9HBI1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PARVBQ9HBI1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PARVBQ9HBI1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PARVBQ9HBI1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PARVBQ9HBI1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARVBQ9HBI1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PARVBQ9HBI1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARVBQ9HBI1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARVBQ9HBI1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PARVBQ9HBI1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PARVBQ9HBI1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PARVBQ9HBI1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PARVBQ9HBI1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PARVBQ9HBI1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARVBQ9HBI1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PARVBQ9HBI1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PARVBQ9HBI1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PARVBQ9HBI1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARVBQ9HBI1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARVBQ9HBI1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PARVBQ9HBI1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PARVBQ9HBI1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PARVBQ9HBI1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PARVBQ9HBI1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PARVBQ9HBI1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PARVBQ9HBI1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PARVBQ9HBI1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARVBQ9HBI1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARVBQ9HBI1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARVBQ9HBI1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARVBQ9HBI1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PARVBQ9HBI1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PARVBQ9HBI1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PARVBQ9HBI1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PARVBQ9HBI1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARVBQ9HBI1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PARVBQ9HBI1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PARVBQ9HBI1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARVBQ9HBI1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARVBQ9HBI1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARVBQ9HBI1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARVBQ9HBI1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PARVBQ9HBI1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PARVBQ9HBI1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PARVBQ9HBI1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PARVBQ9HBI1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PARVBQ9HBI1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PARVBQ9HBI1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PARVBQ9HBI1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PARVBQ9HBI1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARVBQ9HBI1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PARVBQ9HBI1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PARVBQ9HBI1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PARVBQ9HBI1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARVBQ9HBI1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms