Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC56.93■■■■■ 6.7
PRXQ9BXM0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC55.88■■■■■ 6.54
PRXQ9BXM0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.45■■■■■ 6.47
PRXQ9BXM0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.06■■■■■ 6.4
PRXQ9BXM0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.04■■■■■ 6.4
PRXQ9BXM0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC54.94■■■■■ 6.39
PRXQ9BXM0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.9■■■■■ 6.38
PRXQ9BXM0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC54.63■■■■■ 6.34
PRXQ9BXM0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.44■■■■■ 6.15
PRXQ9BXM0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC53.4■■■■■ 6.14
PRXQ9BXM0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53.3■■■■■ 6.12
PRXQ9BXM0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC53.26■■■■■ 6.12
PRXQ9BXM0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC53.15■■■■■ 6.1
PRXQ9BXM0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC53.15■■■■■ 6.1
PRXQ9BXM0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.08■■■■■ 6.09
PRXQ9BXM0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.76■■■■■ 6.04
PRXQ9BXM0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC52.7■■■■■ 6.03
PRXQ9BXM0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.58■■■■■ 6.01
PRXQ9BXM0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC52.45■■■■■ 5.99
PRXQ9BXM0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.41■■■■■ 5.98
PRXQ9BXM0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.32■■■■■ 5.97
PRXQ9BXM0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC52.26■■■■■ 5.96
PRXQ9BXM0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.25■■■■■ 5.96
PRXQ9BXM0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.86■■■■■ 5.89
PRXQ9BXM0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.72■■■■■ 5.87
PRXQ9BXM0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC51.72■■■■■ 5.87
PRXQ9BXM0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.59■■■■■ 5.85
PRXQ9BXM0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC51.49■■■■■ 5.83
PRXQ9BXM0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC51.35■■■■■ 5.81
PRXQ9BXM0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.24■■■■■ 5.79
PRXQ9BXM0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC51.07■■■■■ 5.77
PRXQ9BXM0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.06■■■■■ 5.76
PRXQ9BXM0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
PRXQ9BXM0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.88■■■■■ 5.74
PRXQ9BXM0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC50.84■■■■■ 5.73
PRXQ9BXM0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.83■■■■■ 5.73
PRXQ9BXM0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC50.74■■■■■ 5.71
PRXQ9BXM0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC50.69■■■■■ 5.7
PRXQ9BXM0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC50.68■■■■■ 5.7
PRXQ9BXM0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC50.6■■■■■ 5.69
PRXQ9BXM0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC50.52■■■■■ 5.68
PRXQ9BXM0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
PRXQ9BXM0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
PRXQ9BXM0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC50.36■■■■■ 5.65
PRXQ9BXM0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.35■■■■■ 5.65
PRXQ9BXM0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.59
PRXQ9BXM0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC49.81■■■■■ 5.56
PRXQ9BXM0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC49.8■■■■■ 5.56
PRXQ9BXM0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
PRXQ9BXM0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
PRXQ9BXM0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
PRXQ9BXM0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC49.47■■■■■ 5.51
PRXQ9BXM0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
PRXQ9BXM0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.35■■■■■ 5.49
PRXQ9BXM0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC49.33■■■■■ 5.49
PRXQ9BXM0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.33■■■■■ 5.49
PRXQ9BXM0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC49.31■■■■■ 5.48
PRXQ9BXM0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC49.25■■■■■ 5.48
PRXQ9BXM0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.25■■■■■ 5.48
PRXQ9BXM0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC49.24■■■■■ 5.47
PRXQ9BXM0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.47
PRXQ9BXM0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
PRXQ9BXM0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
PRXQ9BXM0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.15■■■■■ 5.46
PRXQ9BXM0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC49.14■■■■■ 5.46
PRXQ9BXM0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
PRXQ9BXM0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC49.11■■■■■ 5.45
PRXQ9BXM0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.94■■■■■ 5.43
PRXQ9BXM0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC48.94■■■■■ 5.42
PRXQ9BXM0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.87■■■■■ 5.41
PRXQ9BXM0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
PRXQ9BXM0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.83■■■■■ 5.41
PRXQ9BXM0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC48.8■■■■■ 5.4
PRXQ9BXM0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC48.79■■■■■ 5.4
PRXQ9BXM0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC48.78■■■■■ 5.4
PRXQ9BXM0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC48.77■■■■■ 5.4
PRXQ9BXM0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.39
PRXQ9BXM0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
PRXQ9BXM0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC48.71■■■■■ 5.39
PRXQ9BXM0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC48.65■■■■■ 5.38
PRXQ9BXM0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
PRXQ9BXM0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC48.64■■■■■ 5.38
PRXQ9BXM0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
PRXQ9BXM0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.56■■■■■ 5.36
PRXQ9BXM0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC48.48■■■■■ 5.35
PRXQ9BXM0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
PRXQ9BXM0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC48.48■■■■■ 5.35
PRXQ9BXM0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.44■■■■■ 5.35
PRXQ9BXM0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
PRXQ9BXM0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.39■■■■■ 5.34
PRXQ9BXM0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.38■■■■■ 5.34
PRXQ9BXM0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC48.35■■■■■ 5.33
PRXQ9BXM0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
PRXQ9BXM0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
PRXQ9BXM0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
PRXQ9BXM0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
PRXQ9BXM0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.19■■■■■ 5.31
PRXQ9BXM0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC48.17■■■■■ 5.3
PRXQ9BXM0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
PRXQ9BXM0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.15■■■■■ 5.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms