Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
PRXQ9BXM0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
PRXQ9BXM0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
PRXQ9BXM0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC47.98■■■■■ 5.27
PRXQ9BXM0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC47.96■■■■■ 5.27
PRXQ9BXM0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.91■■■■■ 5.26
PRXQ9BXM0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC47.84■■■■■ 5.25
PRXQ9BXM0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC47.84■■■■■ 5.25
PRXQ9BXM0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
PRXQ9BXM0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
PRXQ9BXM0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC47.72■■■■■ 5.23
PRXQ9BXM0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
PRXQ9BXM0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC47.69■■■■■ 5.22
PRXQ9BXM0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
PRXQ9BXM0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
PRXQ9BXM0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC47.65■■■■■ 5.22
PRXQ9BXM0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
PRXQ9BXM0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
PRXQ9BXM0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
PRXQ9BXM0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC47.56■■■■■ 5.2
PRXQ9BXM0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC47.52■■■■■ 5.2
PRXQ9BXM0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
PRXQ9BXM0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.51■■■■■ 5.2
PRXQ9BXM0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC47.45■■■■■ 5.19
PRXQ9BXM0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC47.43■■■■■ 5.18
PRXQ9BXM0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC47.43■■■■■ 5.18
PRXQ9BXM0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC47.4■■■■■ 5.18
PRXQ9BXM0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
PRXQ9BXM0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC47.36■■■■■ 5.17
PRXQ9BXM0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
PRXQ9BXM0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
PRXQ9BXM0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
PRXQ9BXM0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.24■■■■■ 5.15
PRXQ9BXM0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
PRXQ9BXM0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC47.19■■■■■ 5.15
PRXQ9BXM0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
PRXQ9BXM0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC47.16■■■■■ 5.14
PRXQ9BXM0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
PRXQ9BXM0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC47.14■■■■■ 5.14
PRXQ9BXM0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
PRXQ9BXM0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC47.13■■■■■ 5.13
PRXQ9BXM0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.02■■■■■ 5.12
PRXQ9BXM0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
PRXQ9BXM0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC47.02■■■■■ 5.12
PRXQ9BXM0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC47.01■■■■■ 5.12
PRXQ9BXM0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC47■■■■■ 5.11
PRXQ9BXM0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC46.99■■■■■ 5.11
PRXQ9BXM0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC46.97■■■■■ 5.11
PRXQ9BXM0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
PRXQ9BXM0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.87■■■■■ 5.09
PRXQ9BXM0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC46.87■■■■■ 5.09
PRXQ9BXM0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC46.86■■■■■ 5.09
PRXQ9BXM0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
PRXQ9BXM0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC46.83■■■■■ 5.09
PRXQ9BXM0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC46.81■■■■■ 5.08
PRXQ9BXM0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC46.81■■■■■ 5.08
PRXQ9BXM0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC46.77■■■■■ 5.08
PRXQ9BXM0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC46.76■■■■■ 5.08
PRXQ9BXM0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
PRXQ9BXM0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
PRXQ9BXM0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC46.74■■■■■ 5.07
PRXQ9BXM0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
PRXQ9BXM0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC46.72■■■■■ 5.07
PRXQ9BXM0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC46.71■■■■■ 5.07
PRXQ9BXM0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
PRXQ9BXM0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC46.7■■■■■ 5.07
PRXQ9BXM0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
PRXQ9BXM0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
PRXQ9BXM0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
PRXQ9BXM0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC46.62■■■■■ 5.05
PRXQ9BXM0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.55■■■■■ 5.04
PRXQ9BXM0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC46.55■■■■■ 5.04
PRXQ9BXM0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC46.53■■■■■ 5.04
PRXQ9BXM0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
PRXQ9BXM0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
PRXQ9BXM0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC46.45■■■■■ 5.03
PRXQ9BXM0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
PRXQ9BXM0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC46.44■■■■■ 5.03
PRXQ9BXM0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.44■■■■■ 5.03
PRXQ9BXM0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
PRXQ9BXM0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
PRXQ9BXM0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
PRXQ9BXM0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
PRXQ9BXM0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
PRXQ9BXM0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC46.33■■■■■ 5.01
PRXQ9BXM0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
PRXQ9BXM0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
PRXQ9BXM0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
PRXQ9BXM0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
PRXQ9BXM0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC46.25■■■■■ 5
PRXQ9BXM0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
PRXQ9BXM0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC46.24■■■■■ 4.99
PRXQ9BXM0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
PRXQ9BXM0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC46.21■■■■■ 4.99
PRXQ9BXM0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
PRXQ9BXM0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
PRXQ9BXM0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
PRXQ9BXM0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
PRXQ9BXM0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.17■■■■■ 4.98
PRXQ9BXM0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms