Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.52■■■■■ 4.56
BRIP1Q9BX63 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.23■■■■■ 4.51
BRIP1Q9BX63 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
BRIP1Q9BX63 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
BRIP1Q9BX63 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
BRIP1Q9BX63 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.27
BRIP1Q9BX63 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
BRIP1Q9BX63 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
BRIP1Q9BX63 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
BRIP1Q9BX63 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
BRIP1Q9BX63 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
BRIP1Q9BX63 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
BRIP1Q9BX63 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC40.93■■■■■ 4.14
BRIP1Q9BX63 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
BRIP1Q9BX63 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
BRIP1Q9BX63 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
BRIP1Q9BX63 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
BRIP1Q9BX63 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
BRIP1Q9BX63 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
BRIP1Q9BX63 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
BRIP1Q9BX63 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
BRIP1Q9BX63 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
BRIP1Q9BX63 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
BRIP1Q9BX63 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
BRIP1Q9BX63 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
BRIP1Q9BX63 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
BRIP1Q9BX63 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
BRIP1Q9BX63 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
BRIP1Q9BX63 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
BRIP1Q9BX63 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
BRIP1Q9BX63 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
BRIP1Q9BX63 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
BRIP1Q9BX63 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
BRIP1Q9BX63 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
BRIP1Q9BX63 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
BRIP1Q9BX63 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
BRIP1Q9BX63 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
BRIP1Q9BX63 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
BRIP1Q9BX63 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
BRIP1Q9BX63 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
BRIP1Q9BX63 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
BRIP1Q9BX63 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
BRIP1Q9BX63 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
BRIP1Q9BX63 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
BRIP1Q9BX63 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
BRIP1Q9BX63 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
BRIP1Q9BX63 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
BRIP1Q9BX63 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
BRIP1Q9BX63 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
BRIP1Q9BX63 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
BRIP1Q9BX63 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
BRIP1Q9BX63 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
BRIP1Q9BX63 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
BRIP1Q9BX63 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
BRIP1Q9BX63 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
BRIP1Q9BX63 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
BRIP1Q9BX63 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
BRIP1Q9BX63 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
BRIP1Q9BX63 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
BRIP1Q9BX63 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
BRIP1Q9BX63 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
BRIP1Q9BX63 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
BRIP1Q9BX63 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
BRIP1Q9BX63 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
BRIP1Q9BX63 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
BRIP1Q9BX63 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
BRIP1Q9BX63 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
BRIP1Q9BX63 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
BRIP1Q9BX63 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
BRIP1Q9BX63 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
BRIP1Q9BX63 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
BRIP1Q9BX63 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
BRIP1Q9BX63 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
BRIP1Q9BX63 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
BRIP1Q9BX63 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
BRIP1Q9BX63 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
BRIP1Q9BX63 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
BRIP1Q9BX63 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
BRIP1Q9BX63 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
BRIP1Q9BX63 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
BRIP1Q9BX63 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
BRIP1Q9BX63 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
BRIP1Q9BX63 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
BRIP1Q9BX63 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
BRIP1Q9BX63 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
BRIP1Q9BX63 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
BRIP1Q9BX63 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
BRIP1Q9BX63 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
BRIP1Q9BX63 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
BRIP1Q9BX63 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
BRIP1Q9BX63 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
BRIP1Q9BX63 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
BRIP1Q9BX63 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
BRIP1Q9BX63 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
BRIP1Q9BX63 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
BRIP1Q9BX63 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
BRIP1Q9BX63 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
BRIP1Q9BX63 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
BRIP1Q9BX63 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
BRIP1Q9BX63 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms