Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV73

CEP250, Centrosome-associated protein CEP250, humanhuman

Predictions only

Length 2,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP250Q9BV73 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CEP250Q9BV73 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CEP250Q9BV73 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CEP250Q9BV73 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CEP250Q9BV73 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CEP250Q9BV73 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CEP250Q9BV73 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CEP250Q9BV73 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CEP250Q9BV73 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CEP250Q9BV73 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CEP250Q9BV73 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CEP250Q9BV73 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CEP250Q9BV73 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CEP250Q9BV73 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CEP250Q9BV73 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CEP250Q9BV73 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CEP250Q9BV73 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CEP250Q9BV73 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
CEP250Q9BV73 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CEP250Q9BV73 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CEP250Q9BV73 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CEP250Q9BV73 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CEP250Q9BV73 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CEP250Q9BV73 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CEP250Q9BV73 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CEP250Q9BV73 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CEP250Q9BV73 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CEP250Q9BV73 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CEP250Q9BV73 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CEP250Q9BV73 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CEP250Q9BV73 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CEP250Q9BV73 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CEP250Q9BV73 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CEP250Q9BV73 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CEP250Q9BV73 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CEP250Q9BV73 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
CEP250Q9BV73 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CEP250Q9BV73 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CEP250Q9BV73 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CEP250Q9BV73 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CEP250Q9BV73 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CEP250Q9BV73 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CEP250Q9BV73 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP250Q9BV73 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP250Q9BV73 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP250Q9BV73 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP250Q9BV73 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CEP250Q9BV73 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CEP250Q9BV73 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CEP250Q9BV73 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP250Q9BV73 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP250Q9BV73 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CEP250Q9BV73 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CEP250Q9BV73 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CEP250Q9BV73 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CEP250Q9BV73 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CEP250Q9BV73 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CEP250Q9BV73 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP250Q9BV73 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP250Q9BV73 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP250Q9BV73 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP250Q9BV73 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP250Q9BV73 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CEP250Q9BV73 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CEP250Q9BV73 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP250Q9BV73 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP250Q9BV73 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP250Q9BV73 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CEP250Q9BV73 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CEP250Q9BV73 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CEP250Q9BV73 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CEP250Q9BV73 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP250Q9BV73 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP250Q9BV73 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CEP250Q9BV73 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CEP250Q9BV73 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP250Q9BV73 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CEP250Q9BV73 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP250Q9BV73 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CEP250Q9BV73 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
CEP250Q9BV73 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP250Q9BV73 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP250Q9BV73 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP250Q9BV73 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP250Q9BV73 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP250Q9BV73 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CEP250Q9BV73 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP250Q9BV73 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CEP250Q9BV73 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP250Q9BV73 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP250Q9BV73 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP250Q9BV73 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP250Q9BV73 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP250Q9BV73 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP250Q9BV73 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP250Q9BV73 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP250Q9BV73 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP250Q9BV73 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP250Q9BV73 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP250Q9BV73 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms