Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PNKPQ96T60 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PNKPQ96T60 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PNKPQ96T60 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PNKPQ96T60 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PNKPQ96T60 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PNKPQ96T60 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PNKPQ96T60 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PNKPQ96T60 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PNKPQ96T60 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PNKPQ96T60 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PNKPQ96T60 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PNKPQ96T60 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PNKPQ96T60 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PNKPQ96T60 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PNKPQ96T60 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PNKPQ96T60 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PNKPQ96T60 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PNKPQ96T60 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PNKPQ96T60 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PNKPQ96T60 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PNKPQ96T60 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PNKPQ96T60 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PNKPQ96T60 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PNKPQ96T60 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PNKPQ96T60 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PNKPQ96T60 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PNKPQ96T60 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PNKPQ96T60 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PNKPQ96T60 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PNKPQ96T60 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PNKPQ96T60 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PNKPQ96T60 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PNKPQ96T60 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PNKPQ96T60 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PNKPQ96T60 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PNKPQ96T60 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PNKPQ96T60 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PNKPQ96T60 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PNKPQ96T60 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PNKPQ96T60 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PNKPQ96T60 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PNKPQ96T60 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PNKPQ96T60 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PNKPQ96T60 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PNKPQ96T60 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PNKPQ96T60 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PNKPQ96T60 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PNKPQ96T60 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PNKPQ96T60 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PNKPQ96T60 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PNKPQ96T60 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PNKPQ96T60 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PNKPQ96T60 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PNKPQ96T60 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PNKPQ96T60 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PNKPQ96T60 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PNKPQ96T60 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PNKPQ96T60 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PNKPQ96T60 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PNKPQ96T60 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PNKPQ96T60 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PNKPQ96T60 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PNKPQ96T60 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PNKPQ96T60 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PNKPQ96T60 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PNKPQ96T60 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PNKPQ96T60 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PNKPQ96T60 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PNKPQ96T60 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PNKPQ96T60 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PNKPQ96T60 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PNKPQ96T60 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PNKPQ96T60 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PNKPQ96T60 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PNKPQ96T60 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PNKPQ96T60 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PNKPQ96T60 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
PNKPQ96T60 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
PNKPQ96T60 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PNKPQ96T60 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PNKPQ96T60 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PNKPQ96T60 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PNKPQ96T60 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PNKPQ96T60 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PNKPQ96T60 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PNKPQ96T60 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PNKPQ96T60 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PNKPQ96T60 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PNKPQ96T60 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PNKPQ96T60 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PNKPQ96T60 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PNKPQ96T60 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PNKPQ96T60 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PNKPQ96T60 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PNKPQ96T60 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PNKPQ96T60 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PNKPQ96T60 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PNKPQ96T60 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PNKPQ96T60 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms