Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
BBS4Q96RK4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
BBS4Q96RK4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
BBS4Q96RK4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
BBS4Q96RK4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
BBS4Q96RK4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BBS4Q96RK4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BBS4Q96RK4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BBS4Q96RK4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BBS4Q96RK4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
BBS4Q96RK4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
BBS4Q96RK4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BBS4Q96RK4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BBS4Q96RK4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BBS4Q96RK4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BBS4Q96RK4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BBS4Q96RK4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BBS4Q96RK4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BBS4Q96RK4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BBS4Q96RK4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BBS4Q96RK4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BBS4Q96RK4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BBS4Q96RK4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BBS4Q96RK4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BBS4Q96RK4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BBS4Q96RK4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BBS4Q96RK4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BBS4Q96RK4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BBS4Q96RK4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BBS4Q96RK4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BBS4Q96RK4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BBS4Q96RK4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BBS4Q96RK4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BBS4Q96RK4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BBS4Q96RK4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BBS4Q96RK4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BBS4Q96RK4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BBS4Q96RK4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BBS4Q96RK4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BBS4Q96RK4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BBS4Q96RK4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BBS4Q96RK4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BBS4Q96RK4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BBS4Q96RK4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BBS4Q96RK4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BBS4Q96RK4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BBS4Q96RK4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BBS4Q96RK4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BBS4Q96RK4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BBS4Q96RK4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BBS4Q96RK4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BBS4Q96RK4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BBS4Q96RK4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BBS4Q96RK4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BBS4Q96RK4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BBS4Q96RK4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BBS4Q96RK4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BBS4Q96RK4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BBS4Q96RK4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BBS4Q96RK4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BBS4Q96RK4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BBS4Q96RK4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BBS4Q96RK4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BBS4Q96RK4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BBS4Q96RK4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BBS4Q96RK4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BBS4Q96RK4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BBS4Q96RK4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BBS4Q96RK4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BBS4Q96RK4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BBS4Q96RK4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BBS4Q96RK4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BBS4Q96RK4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BBS4Q96RK4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BBS4Q96RK4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BBS4Q96RK4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BBS4Q96RK4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BBS4Q96RK4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BBS4Q96RK4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BBS4Q96RK4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BBS4Q96RK4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BBS4Q96RK4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BBS4Q96RK4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBS4Q96RK4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BBS4Q96RK4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BBS4Q96RK4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BBS4Q96RK4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BBS4Q96RK4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BBS4Q96RK4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BBS4Q96RK4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BBS4Q96RK4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBS4Q96RK4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BBS4Q96RK4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BBS4Q96RK4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBS4Q96RK4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BBS4Q96RK4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BBS4Q96RK4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BBS4Q96RK4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBS4Q96RK4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BBS4Q96RK4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms