Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC51.88■■■■■ 5.9
LMTK3Q96Q04 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.4■■■■■ 5.82
LMTK3Q96Q04 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC50.79■■■■■ 5.72
LMTK3Q96Q04 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.07■■■■■ 5.61
LMTK3Q96Q04 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.92■■■■■ 5.58
LMTK3Q96Q04 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.91■■■■■ 5.58
LMTK3Q96Q04 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
LMTK3Q96Q04 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC49.43■■■■■ 5.5
LMTK3Q96Q04 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.41■■■■■ 5.5
LMTK3Q96Q04 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.14■■■■■ 5.46
LMTK3Q96Q04 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
LMTK3Q96Q04 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
LMTK3Q96Q04 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC48.79■■■■■ 5.4
LMTK3Q96Q04 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC48.54■■■■■ 5.36
LMTK3Q96Q04 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
LMTK3Q96Q04 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.47■■■■■ 5.35
LMTK3Q96Q04 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.25■■■■■ 5.31
LMTK3Q96Q04 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC47.9■■■■■ 5.26
LMTK3Q96Q04 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
LMTK3Q96Q04 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
LMTK3Q96Q04 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC47.84■■■■■ 5.25
LMTK3Q96Q04 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.8■■■■■ 5.24
LMTK3Q96Q04 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC47.7■■■■■ 5.23
LMTK3Q96Q04 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC47.68■■■■■ 5.22
LMTK3Q96Q04 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
LMTK3Q96Q04 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
LMTK3Q96Q04 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
LMTK3Q96Q04 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC47.46■■■■■ 5.19
LMTK3Q96Q04 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC47.45■■■■■ 5.19
LMTK3Q96Q04 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.25■■■■■ 5.15
LMTK3Q96Q04 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
LMTK3Q96Q04 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC46.85■■■■■ 5.09
LMTK3Q96Q04 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.79■■■■■ 5.08
LMTK3Q96Q04 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC46.72■■■■■ 5.07
LMTK3Q96Q04 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
LMTK3Q96Q04 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.54■■■■■ 5.04
LMTK3Q96Q04 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC46.53■■■■■ 5.04
LMTK3Q96Q04 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
LMTK3Q96Q04 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.24■■■■■ 4.99
LMTK3Q96Q04 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC46.22■■■■■ 4.99
LMTK3Q96Q04 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
LMTK3Q96Q04 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
LMTK3Q96Q04 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.03■■■■■ 4.96
LMTK3Q96Q04 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.01■■■■■ 4.96
LMTK3Q96Q04 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC46.01■■■■■ 4.96
LMTK3Q96Q04 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
LMTK3Q96Q04 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC45.89■■■■■ 4.94
LMTK3Q96Q04 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
LMTK3Q96Q04 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
LMTK3Q96Q04 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
LMTK3Q96Q04 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC45.75■■■■■ 4.91
LMTK3Q96Q04 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC45.62■■■■■ 4.89
LMTK3Q96Q04 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC45.62■■■■■ 4.89
LMTK3Q96Q04 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.6■■■■■ 4.89
LMTK3Q96Q04 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
LMTK3Q96Q04 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
LMTK3Q96Q04 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
LMTK3Q96Q04 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
LMTK3Q96Q04 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
LMTK3Q96Q04 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
LMTK3Q96Q04 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
LMTK3Q96Q04 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
LMTK3Q96Q04 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
LMTK3Q96Q04 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
LMTK3Q96Q04 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
LMTK3Q96Q04 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
LMTK3Q96Q04 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
LMTK3Q96Q04 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
LMTK3Q96Q04 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
LMTK3Q96Q04 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
LMTK3Q96Q04 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
LMTK3Q96Q04 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
LMTK3Q96Q04 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
LMTK3Q96Q04 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC44.95■■■■■ 4.79
LMTK3Q96Q04 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
LMTK3Q96Q04 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
LMTK3Q96Q04 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
LMTK3Q96Q04 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
LMTK3Q96Q04 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
LMTK3Q96Q04 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC44.82■■■■■ 4.77
LMTK3Q96Q04 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
LMTK3Q96Q04 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
LMTK3Q96Q04 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC44.78■■■■■ 4.76
LMTK3Q96Q04 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
LMTK3Q96Q04 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
LMTK3Q96Q04 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
LMTK3Q96Q04 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
LMTK3Q96Q04 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
LMTK3Q96Q04 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
LMTK3Q96Q04 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC44.59■■■■■ 4.73
LMTK3Q96Q04 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
LMTK3Q96Q04 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
LMTK3Q96Q04 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC44.49■■■■■ 4.71
LMTK3Q96Q04 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC44.49■■■■■ 4.71
LMTK3Q96Q04 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC44.49■■■■■ 4.71
LMTK3Q96Q04 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC44.45■■■■■ 4.71
LMTK3Q96Q04 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
LMTK3Q96Q04 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
LMTK3Q96Q04 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
LMTK3Q96Q04 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms