Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CALML4Q96GE6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CALML4Q96GE6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CALML4Q96GE6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CALML4Q96GE6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CALML4Q96GE6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CALML4Q96GE6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CALML4Q96GE6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CALML4Q96GE6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CALML4Q96GE6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CALML4Q96GE6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CALML4Q96GE6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CALML4Q96GE6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CALML4Q96GE6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CALML4Q96GE6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CALML4Q96GE6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CALML4Q96GE6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CALML4Q96GE6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CALML4Q96GE6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CALML4Q96GE6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CALML4Q96GE6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CALML4Q96GE6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CALML4Q96GE6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CALML4Q96GE6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CALML4Q96GE6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CALML4Q96GE6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CALML4Q96GE6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CALML4Q96GE6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CALML4Q96GE6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CALML4Q96GE6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CALML4Q96GE6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CALML4Q96GE6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CALML4Q96GE6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CALML4Q96GE6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CALML4Q96GE6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CALML4Q96GE6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CALML4Q96GE6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CALML4Q96GE6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CALML4Q96GE6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CALML4Q96GE6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CALML4Q96GE6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CALML4Q96GE6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CALML4Q96GE6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CALML4Q96GE6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CALML4Q96GE6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CALML4Q96GE6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CALML4Q96GE6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CALML4Q96GE6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CALML4Q96GE6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CALML4Q96GE6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CALML4Q96GE6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CALML4Q96GE6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CALML4Q96GE6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CALML4Q96GE6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CALML4Q96GE6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CALML4Q96GE6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CALML4Q96GE6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CALML4Q96GE6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CALML4Q96GE6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CALML4Q96GE6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CALML4Q96GE6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CALML4Q96GE6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CALML4Q96GE6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CALML4Q96GE6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CALML4Q96GE6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CALML4Q96GE6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CALML4Q96GE6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CALML4Q96GE6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CALML4Q96GE6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CALML4Q96GE6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CALML4Q96GE6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CALML4Q96GE6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CALML4Q96GE6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CALML4Q96GE6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CALML4Q96GE6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CALML4Q96GE6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CALML4Q96GE6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CALML4Q96GE6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CALML4Q96GE6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CALML4Q96GE6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CALML4Q96GE6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CALML4Q96GE6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CALML4Q96GE6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CALML4Q96GE6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CALML4Q96GE6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CALML4Q96GE6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CALML4Q96GE6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CALML4Q96GE6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CALML4Q96GE6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CALML4Q96GE6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CALML4Q96GE6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CALML4Q96GE6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CALML4Q96GE6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CALML4Q96GE6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CALML4Q96GE6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CALML4Q96GE6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CALML4Q96GE6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CALML4Q96GE6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CALML4Q96GE6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
CALML4Q96GE6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms