Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC48.89■■■■■ 5.42
SIRT1Q96EB6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC48.29■■■■■ 5.32
SIRT1Q96EB6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
SIRT1Q96EB6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.54■■■■■ 5.2
SIRT1Q96EB6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
SIRT1Q96EB6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
SIRT1Q96EB6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47■■■■■ 5.11
SIRT1Q96EB6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC46.68■■■■■ 5.06
SIRT1Q96EB6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.19■■■■■ 4.98
SIRT1Q96EB6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
SIRT1Q96EB6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC45.87■■■■■ 4.93
SIRT1Q96EB6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC45.77■■■■■ 4.92
SIRT1Q96EB6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
SIRT1Q96EB6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
SIRT1Q96EB6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
SIRT1Q96EB6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
SIRT1Q96EB6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
SIRT1Q96EB6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
SIRT1Q96EB6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
SIRT1Q96EB6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
SIRT1Q96EB6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
SIRT1Q96EB6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
SIRT1Q96EB6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
SIRT1Q96EB6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
SIRT1Q96EB6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
SIRT1Q96EB6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC44.52■■■■■ 4.72
SIRT1Q96EB6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
SIRT1Q96EB6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
SIRT1Q96EB6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
SIRT1Q96EB6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
SIRT1Q96EB6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
SIRT1Q96EB6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
SIRT1Q96EB6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
SIRT1Q96EB6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
SIRT1Q96EB6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC43.83■■■■■ 4.61
SIRT1Q96EB6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
SIRT1Q96EB6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC43.73■■■■■ 4.59
SIRT1Q96EB6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
SIRT1Q96EB6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
SIRT1Q96EB6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
SIRT1Q96EB6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
SIRT1Q96EB6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
SIRT1Q96EB6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
SIRT1Q96EB6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
SIRT1Q96EB6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
SIRT1Q96EB6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
SIRT1Q96EB6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
SIRT1Q96EB6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
SIRT1Q96EB6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
SIRT1Q96EB6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
SIRT1Q96EB6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
SIRT1Q96EB6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
SIRT1Q96EB6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
SIRT1Q96EB6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
SIRT1Q96EB6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
SIRT1Q96EB6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
SIRT1Q96EB6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
SIRT1Q96EB6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SIRT1Q96EB6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
SIRT1Q96EB6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
SIRT1Q96EB6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
SIRT1Q96EB6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
SIRT1Q96EB6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
SIRT1Q96EB6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
SIRT1Q96EB6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
SIRT1Q96EB6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SIRT1Q96EB6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
SIRT1Q96EB6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SIRT1Q96EB6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SIRT1Q96EB6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
SIRT1Q96EB6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
SIRT1Q96EB6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
SIRT1Q96EB6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
SIRT1Q96EB6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
SIRT1Q96EB6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
SIRT1Q96EB6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC41.93■■■■■ 4.3
SIRT1Q96EB6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SIRT1Q96EB6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
SIRT1Q96EB6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SIRT1Q96EB6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
SIRT1Q96EB6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
SIRT1Q96EB6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
SIRT1Q96EB6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
SIRT1Q96EB6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
SIRT1Q96EB6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
SIRT1Q96EB6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SIRT1Q96EB6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.72■■■■■ 4.27
SIRT1Q96EB6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
SIRT1Q96EB6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
SIRT1Q96EB6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
SIRT1Q96EB6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
SIRT1Q96EB6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
SIRT1Q96EB6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SIRT1Q96EB6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
SIRT1Q96EB6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SIRT1Q96EB6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
SIRT1Q96EB6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
SIRT1Q96EB6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
SIRT1Q96EB6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
SIRT1Q96EB6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC41.38■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms