Protein–RNA interactions for Protein: Q96DA2

RAB39B, Ras-related protein Rab-39B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39BQ96DA2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB39BQ96DA2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB39BQ96DA2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB39BQ96DA2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB39BQ96DA2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB39BQ96DA2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB39BQ96DA2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB39BQ96DA2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RAB39BQ96DA2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB39BQ96DA2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB39BQ96DA2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB39BQ96DA2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB39BQ96DA2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB39BQ96DA2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB39BQ96DA2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB39BQ96DA2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB39BQ96DA2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB39BQ96DA2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB39BQ96DA2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB39BQ96DA2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB39BQ96DA2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB39BQ96DA2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB39BQ96DA2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB39BQ96DA2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB39BQ96DA2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB39BQ96DA2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB39BQ96DA2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB39BQ96DA2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB39BQ96DA2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB39BQ96DA2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB39BQ96DA2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB39BQ96DA2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB39BQ96DA2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB39BQ96DA2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB39BQ96DA2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB39BQ96DA2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB39BQ96DA2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB39BQ96DA2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB39BQ96DA2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB39BQ96DA2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB39BQ96DA2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB39BQ96DA2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB39BQ96DA2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB39BQ96DA2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB39BQ96DA2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB39BQ96DA2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB39BQ96DA2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB39BQ96DA2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB39BQ96DA2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB39BQ96DA2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB39BQ96DA2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB39BQ96DA2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB39BQ96DA2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB39BQ96DA2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB39BQ96DA2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB39BQ96DA2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB39BQ96DA2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB39BQ96DA2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB39BQ96DA2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB39BQ96DA2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB39BQ96DA2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB39BQ96DA2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB39BQ96DA2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB39BQ96DA2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB39BQ96DA2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB39BQ96DA2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB39BQ96DA2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB39BQ96DA2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB39BQ96DA2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB39BQ96DA2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB39BQ96DA2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB39BQ96DA2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB39BQ96DA2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB39BQ96DA2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB39BQ96DA2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB39BQ96DA2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB39BQ96DA2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB39BQ96DA2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB39BQ96DA2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB39BQ96DA2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB39BQ96DA2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB39BQ96DA2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB39BQ96DA2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB39BQ96DA2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB39BQ96DA2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB39BQ96DA2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB39BQ96DA2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB39BQ96DA2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB39BQ96DA2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB39BQ96DA2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB39BQ96DA2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB39BQ96DA2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB39BQ96DA2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB39BQ96DA2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB39BQ96DA2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB39BQ96DA2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB39BQ96DA2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB39BQ96DA2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB39BQ96DA2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB39BQ96DA2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 262.6 ms