Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CLUAP1Q96AJ1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CLUAP1Q96AJ1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
CLUAP1Q96AJ1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CLUAP1Q96AJ1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CLUAP1Q96AJ1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CLUAP1Q96AJ1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CLUAP1Q96AJ1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
CLUAP1Q96AJ1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
CLUAP1Q96AJ1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CLUAP1Q96AJ1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
CLUAP1Q96AJ1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CLUAP1Q96AJ1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CLUAP1Q96AJ1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CLUAP1Q96AJ1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CLUAP1Q96AJ1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CLUAP1Q96AJ1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CLUAP1Q96AJ1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
CLUAP1Q96AJ1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
CLUAP1Q96AJ1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
CLUAP1Q96AJ1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CLUAP1Q96AJ1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CLUAP1Q96AJ1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CLUAP1Q96AJ1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CLUAP1Q96AJ1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CLUAP1Q96AJ1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CLUAP1Q96AJ1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CLUAP1Q96AJ1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CLUAP1Q96AJ1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CLUAP1Q96AJ1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CLUAP1Q96AJ1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CLUAP1Q96AJ1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CLUAP1Q96AJ1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CLUAP1Q96AJ1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CLUAP1Q96AJ1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CLUAP1Q96AJ1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CLUAP1Q96AJ1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CLUAP1Q96AJ1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CLUAP1Q96AJ1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CLUAP1Q96AJ1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CLUAP1Q96AJ1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CLUAP1Q96AJ1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CLUAP1Q96AJ1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CLUAP1Q96AJ1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CLUAP1Q96AJ1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CLUAP1Q96AJ1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CLUAP1Q96AJ1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CLUAP1Q96AJ1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.74
CLUAP1Q96AJ1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CLUAP1Q96AJ1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CLUAP1Q96AJ1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CLUAP1Q96AJ1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CLUAP1Q96AJ1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CLUAP1Q96AJ1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CLUAP1Q96AJ1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CLUAP1Q96AJ1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CLUAP1Q96AJ1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CLUAP1Q96AJ1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CLUAP1Q96AJ1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CLUAP1Q96AJ1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CLUAP1Q96AJ1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CLUAP1Q96AJ1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CLUAP1Q96AJ1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CLUAP1Q96AJ1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CLUAP1Q96AJ1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CLUAP1Q96AJ1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
CLUAP1Q96AJ1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CLUAP1Q96AJ1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CLUAP1Q96AJ1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CLUAP1Q96AJ1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CLUAP1Q96AJ1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CLUAP1Q96AJ1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
CLUAP1Q96AJ1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CLUAP1Q96AJ1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CLUAP1Q96AJ1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CLUAP1Q96AJ1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CLUAP1Q96AJ1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CLUAP1Q96AJ1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CLUAP1Q96AJ1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CLUAP1Q96AJ1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CLUAP1Q96AJ1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLUAP1Q96AJ1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLUAP1Q96AJ1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLUAP1Q96AJ1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CLUAP1Q96AJ1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CLUAP1Q96AJ1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CLUAP1Q96AJ1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CLUAP1Q96AJ1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CLUAP1Q96AJ1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CLUAP1Q96AJ1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CLUAP1Q96AJ1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CLUAP1Q96AJ1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CLUAP1Q96AJ1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
CLUAP1Q96AJ1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CLUAP1Q96AJ1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CLUAP1Q96AJ1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CLUAP1Q96AJ1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
CLUAP1Q96AJ1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CLUAP1Q96AJ1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CLUAP1Q96AJ1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms