Protein–RNA interactions for Protein: Q96A83

COL26A1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL26A1Q96A83 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
COL26A1Q96A83 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
COL26A1Q96A83 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
COL26A1Q96A83 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
COL26A1Q96A83 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
COL26A1Q96A83 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
COL26A1Q96A83 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
COL26A1Q96A83 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
COL26A1Q96A83 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
COL26A1Q96A83 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
COL26A1Q96A83 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
COL26A1Q96A83 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
COL26A1Q96A83 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
COL26A1Q96A83 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
COL26A1Q96A83 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
COL26A1Q96A83 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
COL26A1Q96A83 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
COL26A1Q96A83 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
COL26A1Q96A83 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
COL26A1Q96A83 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
COL26A1Q96A83 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
COL26A1Q96A83 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
COL26A1Q96A83 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
COL26A1Q96A83 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COL26A1Q96A83 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL26A1Q96A83 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL26A1Q96A83 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL26A1Q96A83 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COL26A1Q96A83 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL26A1Q96A83 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL26A1Q96A83 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COL26A1Q96A83 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COL26A1Q96A83 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL26A1Q96A83 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL26A1Q96A83 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL26A1Q96A83 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL26A1Q96A83 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL26A1Q96A83 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL26A1Q96A83 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL26A1Q96A83 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL26A1Q96A83 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL26A1Q96A83 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL26A1Q96A83 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL26A1Q96A83 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL26A1Q96A83 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL26A1Q96A83 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL26A1Q96A83 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL26A1Q96A83 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL26A1Q96A83 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
COL26A1Q96A83 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL26A1Q96A83 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL26A1Q96A83 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL26A1Q96A83 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
COL26A1Q96A83 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL26A1Q96A83 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL26A1Q96A83 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL26A1Q96A83 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL26A1Q96A83 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL26A1Q96A83 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL26A1Q96A83 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
COL26A1Q96A83 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL26A1Q96A83 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL26A1Q96A83 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL26A1Q96A83 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL26A1Q96A83 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL26A1Q96A83 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL26A1Q96A83 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COL26A1Q96A83 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL26A1Q96A83 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL26A1Q96A83 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL26A1Q96A83 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL26A1Q96A83 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL26A1Q96A83 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL26A1Q96A83 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL26A1Q96A83 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL26A1Q96A83 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL26A1Q96A83 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL26A1Q96A83 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL26A1Q96A83 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL26A1Q96A83 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL26A1Q96A83 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL26A1Q96A83 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL26A1Q96A83 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL26A1Q96A83 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
COL26A1Q96A83 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL26A1Q96A83 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL26A1Q96A83 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL26A1Q96A83 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL26A1Q96A83 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL26A1Q96A83 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL26A1Q96A83 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL26A1Q96A83 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL26A1Q96A83 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL26A1Q96A83 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL26A1Q96A83 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL26A1Q96A83 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL26A1Q96A83 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL26A1Q96A83 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL26A1Q96A83 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL26A1Q96A83 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms